Администрирование онлайн-библиотеки осуществляется по следующей схеме:

1. Библиотечный комитет при Совете ЕААА осуществляет общее руководство и стратегическое планирование развития библиотеки.
2. Администратор библиотеки осуществляет непосредстенное руководство и решение вопросов работы и развития библиотеки.
3. Библиотекари-менеджеры от учебных заведений осуществляют текущую работу по регистрации и обслуживанию читателей библотеки. 

Онлайн-библиотека ЕААА сотрудничает с библиотеками тех учебных заведений, которые заключили с ЕААА договор о некоммерческом партнерстве в области развития онлайн-ресурсов. Это подавляющее большинство библиотек учебных заведений, входящих в Евро-азиатскую аккредитационную ассоциацию.